產(chǎn)品詳情介紹
TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?是針對(duì)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)開發(fā)的，適用于普通哺乳動(dòng)物細(xì)胞的ATAC文庫構(gòu)建試劑盒，所得文庫可用于單端或雙端測(cè)序。該試劑盒采用新型的轉(zhuǎn)座酶技術(shù)，針對(duì)染色質(zhì)開放區(qū)域建庫測(cè)序，僅需3個(gè)小時(shí)即可完成實(shí)驗(yàn)。所需細(xì)胞量少，10-50000細(xì)胞的起始量均可以獲得高分辨率的測(cè)序圖譜。
文庫產(chǎn)量高
對(duì)3種哺乳動(dòng)物細(xì)胞以50,000、10,000 cells為起始細(xì)胞投入量進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建。結(jié)果表明， TransGen產(chǎn)品針對(duì)不同細(xì)胞及投入量，均可構(gòu)建高產(chǎn)量文庫。
細(xì)胞起始量低
對(duì)不同細(xì)胞投入量（50-1,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建，不同細(xì)胞投入量的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)如上表。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品可用于構(gòu)建低起始量（50個(gè)細(xì)胞）的ATAC文庫，文庫產(chǎn)量高，峰型好。
與競(jìng)品比較
分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對(duì)不同細(xì)胞投入量（5,000-50,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品的文庫產(chǎn)量、文庫峰型與競(jìng)品相比，優(yōu)于競(jìng)品。
下機(jī)數(shù)據(jù)好
對(duì)不同細(xì)胞投入量（50-50,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫構(gòu)建，將構(gòu)建后的文庫測(cè)序，下機(jī)后進(jìn)行生信分析。結(jié)果表明，TSS富集圖顯示在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周圍富集明顯，IGV視圖顯示ATAC在關(guān)鍵位點(diǎn)與H3K4me3基因的ChIP-seq結(jié)果一致，實(shí)驗(yàn)結(jié)果真實(shí)可靠。
